Sveriges bistånd till Kambodja inleddes med humanitära insatser. Sverige var ett av de första länder som lämnade humanitärt stöd till Kambodja efter Röda khmerernas fall 1979. Det långsiktiga utvecklingssamarbetet inleddes under 1990-talet.
Regeringen beslutade den 11 juni 2020 att fokusera det bilaterala utvecklingssamarbetet till Kambodja och fasa ut Sveriges stöd till utbildningssektorn, decentralisering och miljö och klimat. Det bilaterala landfönstret inom den regionala strategin för utvecklingssamarbetet med Asien och Oceanien 2021–2026 möjliggjorde för fortsatt direkt stöd till icke-statliga aktörer i Kambodja inom mänskliga rättigheter, demokrati och rättsstatens principer. I november stängdes Sveriges ambassad i Phnom Penh den 1 december 2021 omvandlades ambassaden i Kambodja till ett sektionskansli, under ambassaden i Bangkok.
Den 22 december 2023 beslutade regeringen att fasa ut det bilaterala utvecklingssamarbete till Kambodja per den 31 dec 2024 och således beslutades också att sektionskansliet i Phnom Penh ska stängas den 30 september 2024. All biståndsverksamhet fram till dec 2024 flyttas till Sida i Stockholm från den 15 augusti.
Ambassaden i Bangkok fortsätter representera Sverige i Kambodja och den regionala strategin för utvecklingssamarbetet med Asien och Oceanien 2021–2026 kommer även fortsatt att omfatta Kambodja med insatser utifrån ett regionalt perspektiv.